Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mkrn2Q9ERV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms