Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms