Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snap29Q9ERB0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms