Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfcp2Q9ERA0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfcp2Q9ERA0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms