Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx6Q9ER75 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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