Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms