Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms