Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smg9Q9DB90 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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