Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms