Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms