Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmigd1Q9D7L8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmigd1Q9D7L8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms