Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms