Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms