Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rtl8cQ9D6I0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rtl8cQ9D6I0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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