Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms