Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdr42e1Q9D665 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sdr42e1Q9D665 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdr42e1Q9D665 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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