Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3404Q9D506 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms