Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl3Q9D4V7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms