Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms