Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms