Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcc1Q9D4H2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcc1Q9D4H2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms