Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms