Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms