Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Zbed3Q9D0L1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms