Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms