Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms