Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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