Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYI0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms