Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrs1Q9CYH6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms