Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms