Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih4Q9CX13 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms