Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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