Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms