Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Filip1Q9CS72 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms