Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms