Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ykt6Q9CQW1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ykt6Q9CQW1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ykt6Q9CQW1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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