Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms