Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms