Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc5Q9CQA1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms