Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms