Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms