Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp3Q9CQ10 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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