Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms