Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms