Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac9Q99N13 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms