Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms