Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms