Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp16Q99LG0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms