Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms