Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms